MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017167	CGGA	2	8	65964	65971	25 %	0 %	50 %	25 %	384133848
1503	NC_017167	TGG	2	6	66003	66008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133848
1504	NC_017167	GGCC	2	8	66063	66070	0 %	0 %	50 %	50 %	384133848
1505	NC_017167	AGA	2	6	66117	66122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133848
1506	NC_017167	CGG	2	6	66129	66134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1507	NC_017167	CGA	2	6	66136	66141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1508	NC_017167	GCG	2	6	66182	66187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1509	NC_017167	GC	3	6	66264	66269	0 %	0 %	50 %	50 %	384133848
1510	NC_017167	TCG	2	6	66270	66275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1511	NC_017167	CTGC	2	8	66333	66340	0 %	25 %	25 %	50 %	384133848
1512	NC_017167	CGT	2	6	66381	66386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1513	NC_017167	GTC	2	6	66427	66432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1514	NC_017167	GC	3	6	66434	66439	0 %	0 %	50 %	50 %	384133848
1515	NC_017167	GAGGC	2	10	66446	66455	20 %	0 %	60 %	20 %	384133848
1516	NC_017167	TGA	2	6	66531	66536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133848
1517	NC_017167	CGG	2	6	66537	66542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133848
1518	NC_017167	TCT	2	6	66561	66566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133848
1519	NC_017167	CAG	2	6	66693	66698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133848
1520	NC_017167	GGGA	2	8	66730	66737	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017167	CG	3	6	66764	66769	0 %	0 %	50 %	50 %	384133849
1522	NC_017167	ACG	2	6	66789	66794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1523	NC_017167	GAG	2	6	66828	66833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133849
1524	NC_017167	CG	4	8	66857	66864	0 %	0 %	50 %	50 %	384133849
1525	NC_017167	GC	3	6	66902	66907	0 %	0 %	50 %	50 %	384133849
1526	NC_017167	ATGCA	2	10	67024	67033	40 %	20 %	20 %	20 %	384133849
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1529	NC_017167	GCG	2	6	67126	67131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133849
1530	NC_017167	GTT	2	6	67142	67147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133849
1531	NC_017167	CGG	2	6	67195	67200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133849
1532	NC_017167	CGT	2	6	67217	67222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1533	NC_017167	GATC	2	8	67223	67230	25 %	25 %	25 %	25 %	384133849
1534	NC_017167	CAT	2	6	67266	67271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133849
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1537	NC_017167	GCG	2	6	67420	67425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133849
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1539	NC_017167	GC	3	6	67504	67509	0 %	0 %	50 %	50 %	384133849
1540	NC_017167	GCG	3	9	67515	67523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133849
1541	NC_017167	CGA	2	6	67568	67573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133849
1542	NC_017167	GAC	2	6	67607	67612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133849
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1545	NC_017167	GCC	2	6	67650	67655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133849
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1549	NC_017167	CGGAG	2	10	67738	67747	20 %	0 %	60 %	20 %	384133849
1550	NC_017167	GAG	2	6	67811	67816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133850
1551	NC_017167	GGT	3	9	67837	67845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133850
1552	NC_017167	TCC	2	6	67917	67922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133850
1553	NC_017167	ACG	2	6	67950	67955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133850
1554	NC_017167	GAT	2	6	67981	67986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133850
1555	NC_017167	CAT	2	6	67999	68004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133850
1556	NC_017167	GAA	2	6	68035	68040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133850
1557	NC_017167	GCA	2	6	68113	68118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133850
1558	NC_017167	GTG	2	6	68153	68158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133850
1559	NC_017167	AGG	2	6	68229	68234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133850
1560	NC_017167	CGG	2	6	68265	68270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133850
1561	NC_017167	ACC	2	6	68273	68278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133850
1562	NC_017167	CG	3	6	68347	68352	0 %	0 %	50 %	50 %	384133851
1563	NC_017167	CGCGAG	2	12	68438	68449	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384133851
1564	NC_017167	CGA	2	6	68465	68470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133851
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1567	NC_017167	GAG	2	6	68585	68590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133851
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1569	NC_017167	CGA	2	6	68603	68608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133851
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1571	NC_017167	CCG	2	6	68635	68640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133851
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1582	NC_017167	GC	3	6	68970	68975	0 %	0 %	50 %	50 %	384133851
1583	NC_017167	CCA	2	6	69028	69033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133851
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1588	NC_017167	CGC	2	6	69237	69242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133851
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1591	NC_017167	TCGCG	2	10	69415	69424	0 %	20 %	40 %	40 %	384133851
1592	NC_017167	CGA	2	6	69472	69477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133851
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1595	NC_017167	GCG	2	6	69573	69578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133851
1596	NC_017167	GTTG	2	8	69607	69614	0 %	50 %	50 %	0 %	384133851
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1601	NC_017167	CGT	2	6	69839	69844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133851
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1603	NC_017167	GAT	2	6	69941	69946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133851
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1607	NC_017167	CGC	2	6	70144	70149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133852
1608	NC_017167	GC	3	6	70153	70158	0 %	0 %	50 %	50 %	384133852
1609	NC_017167	TCT	2	6	70161	70166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133852
1610	NC_017167	GAC	2	6	70180	70185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133852
1611	NC_017167	GGAT	2	8	70293	70300	25 %	25 %	50 %	0 %	384133852
1612	NC_017167	GAA	2	6	70341	70346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133852
1613	NC_017167	TCG	2	6	70373	70378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133852
1614	NC_017167	GCG	2	6	70402	70407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133852
1615	NC_017167	GCGTG	2	10	70450	70459	0 %	20 %	60 %	20 %	384133852
1616	NC_017167	CCG	2	6	70473	70478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133852
1617	NC_017167	CCT	2	6	70519	70524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_017167	GGATT	2	10	70577	70586	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017167	ACGG	2	8	70604	70611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_017167	TCA	2	6	70725	70730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133853
1621	NC_017167	CGT	2	6	70731	70736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133853
1622	NC_017167	CGA	2	6	70761	70766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133853
1623	NC_017167	CGC	2	6	70813	70818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133853
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